El cántabro formará parte del grupo de entrenadores asistentes del conjunto que dirigirá Joan Peñarroya tras anunciar su retirada oficial de las pistas con el propio club valenciano, haciendo una transición que no esperaba y que queda por ver cuanto durará, según comentaba el propio jugador.
Fernando San Emeterio deja de ser jugador en activo de Valencia Basket para pasar a ser entrenador asistente del conjunto taronja durante la temporada 2021-2022, donde será uno de los encargado de ayudar a Joan Peñarroya en la dirección del equipo, donde seguirán algunos de los que han sido compañeros suyos esta temporada y durante las seis anteriores.
En la rueda de prensa posterior al evento explicaba cuales habían sido sus motivaciones para dar este paso, que a pesar de no ser buscado desde el inicio, si que fue viéndoles aspectos positivos después de que el propio Peñarroya y el club le hiciesen llegar la oferta para cambiar las pistas por los banquillos, como se puede escuchar aquí:
Con todo ello, el cántabro seguirá formando parte de Valencia Basket, se como un asistente más y no tan concretamente como segundo entrenador (cosa que no menciona en el audio pero quiso aclarar posteriormente), en un tramo de su vida en el que también podría recibir una llamada de la selección para ayudar a «chavales y chavalines» tal como ha expresado Sergio Scariolo en la rueda de prensa tras el encuentro frente a Irán.
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